Në debatin rreth marrëdhënies midis fesë dhe shtetit, i cili mbetet aktual edhe sot,  Thomas Jefferson është sërish në qendër të polemikave. Statuti i Xhefersonit në Virxhinia për Lirinë Fetare ishte pararendës i klauzolës së themelimit të Kushtetutës (klauzola që thotë, "Kongresi nuk do të bëjë ligj që respekton një themelim të fesë").

Jefferson gjithashtu popullarizoi frazën e famshme që atje duhet të jetë "një mur ndarjeje" midis kishës dhe shtetit. Por çfarë fshihej pas mbrojtjes së lirisë fetare nga Jefferson? Ky artikull do të eksplorojë arsyet personale dhe politike pas një prej trashëgimive më të rëndësishme të Jefferson-it – ndarjes mes kishës dhe shtetit.

Kur u njoftua se Jefferson do të kërkonte Presidencën, pati raporte se njerëzit po varrosnin biblat e tyre për t'i mbrojtur ata nga ateisti Z. Jefferson. Megjithatë, pavarësisht nga qëndrimi, në rastin më të mirë, ambivalent i Jefferson-it ndaj fesë, ai ishte një besimtar i fortë në të drejtën e praktikës dhe shprehjes së lirë fetare.

Në një letër përgjigje drejtuar Baptistëve të Danbury Connecticut në 1802, të cilët kishin shkruar Xhefersonit në lidhje me frikën e tyre për t'u persekutuar nga kongregacionistët e Danbury Connecticut, Jefferson shkroi:

“Të besosh me ty se feja është një çështje që shtrihet vetëm midis njeriut dhe zotit të tij, që ai nuk i detyrohet llogari askujt tjetër për të tijënbesimin ose adhurimin e tij, që fuqitë legjitime të qeverisë arrijnë vetëm veprime, dhe jo opinione, unë e mendoj me nderim sovran atë akt të të gjithë popullit amerikan që deklaroi se "legjislativi" i tyre nuk duhet të "marrë asnjë ligj që respekton një themelim feje, ose duke ndaluar ushtrimin e lirë të saj, duke ndërtuar kështu një mur ndarjeje midis kishës dhe shtetit.”

Kisha e Shën Lukës në Virxhinia është kisha më e vjetër anglikane e mbijetuar në SHBA dhe daton nga shekulli i 17-të .

Jefferson fillimisht e kishte trajtuar këtë çështje në Statutin e tij të Lirisë Fetare në Virxhinia, i cili u hartua për të shpërbërë Kishën e Anglisë në Virxhinia. Është e qartë se besimi i Xhefersonit në ndarjen midis kishës dhe shtetit buron nga shtypja politike që lind nga themelimi i një kishe kombëtare.

Është gjithashtu e qartë se besimet e Jefferson buronin nga arritjet e mëdha intelektuale dhe filozofike të Iluminizmi i shekullit të 18-të, një periudhë e referuar nga historianët për të treguar një kohë kur arsyeja, shkenca dhe logjika filluan të sfidojnë supremacinë e fesë në sheshin publik.

Është gjithashtu e vërtetë edhe pse Jefferson kishte motive politike për “shpallja e tij e murit të ndarjes”. Armiqtë e tij federalistë në Konektikat ishin kryesisht kongregacionistë. Është gjithashtu rasti që Jefferson donte të mbrohej si President kurai nuk lëshonte proklamata fetare në festat fetare (diçka e kishin bërë paraardhësit e tij).

Duke theksuar publikisht ndarjen ai jo vetëm mbrojti pakicat fetare, si katolikët dhe hebrenjtë, por parandaloi akuzat se ishte antifetar nga thjesht duke thënë se nuk ishte roli i qeverisë të mbështeste apo themelonte ndonjë fe.

Ndarja e kishës nga shteti është një çështje e ndërlikuar që ka baza personale, politike, filozofike dhe ndërkombëtare. Por, duke menduar për këto pika, ne mund të fillojmë të kuptojmë një nga tiparet përcaktuese të Kushtetutës së SHBA-së dhe trashëgiminë e zotit Jefferson.